市生态环境局贯彻执行党中央关于生态环境工作的方针政策和相关法律法规，落实省委、市委决策部署以及中国（海南）自由贸易试验区和中国特色自由贸易港的政策措施，在履行职责过程中坚持和加强党对生态环境工作的集中统一领导。主要职能是：
（一）研究拟订并组织实施本市生态环境保护工作政策法规和发展规划，研究提出本市推进中国（海南）自由贸易试验区、中国特色自由贸易港有关生态环境方面的意见和建议，推进生态环境保护改革。
（二）会同有关部门组织编制并监督实施重点区域、流域、海域、地下水、饮用水水源地生态环境规划和水功能区划。
（三）负责生态环境问题的统筹协调和监督管理。牵头协调环境污染事故、生态破坏事件的调查处理；指导、协调全市突发生态环境事件的应急、预警工作；牵头指导实施生态环境损害赔偿制度；协调解决跨区域环境污染纠纷；统筹协调重点区域、流域、海域生态环境保护工作。
（四）负责监督管理全市减排目标的落实。组织制定并监督实施陆地和海洋各类污染物排放总量控制计划，确定大气、水、海洋等纳污能力；监督检查污染物减排任务完成情况，实施生态环境保护目标责任制；组织实施排污许可证制度。
（五）会同有关部门开展地方党政领导班子和领导干部生态环境保护实绩评价工作。
（六）负责提出生态环境领域固定资产投资、市级财政性资金安排的意见，配合有关部门做好组织实施。参与指导推动循环经济和生态环保产业发展。
（七）负责环境污染防治的监督管理。制定大气、水、海洋、土壤、噪声、光、恶臭、固体废物、化学品、机动车等的污染防治管理制度并监督实施；会同有关部门监督管理饮用水水源地生态环境保护工作，组织指导城乡生态环境综合整治工作，监督指导农业面源污染治理工作。按照国家统一部署，做好区域大气污染联防联控工作。
（八）指导、协调、监督生态保护修复工作，参与推进国家生态文明试验区（海南）建设工作。组织编制生态保护规划；监督对生态环境有影响的自然资源开发利用活动、重要生态环境建设和生态破坏恢复工作；协调、监督生物多样性保护、野生动植物保护、湿地环境保护工作；指导、协调和监督全市农村生态环境保护，指导开展各类生态创建工作和生态示范区建设工作；配合有关部门监督生物技术环境安全，协调做好生物物种（含遗传资源）工作；参与生态保护补偿工作。
（九）负责核与辐射安全的监督管理。监督管理权限内全市核与辐射安全环境保护，配合开展辐射事故应急处置工作。
（十）负责生态环境准入的监督管理。按管理权限组织审批或审查重点开发建设区域、规划、项目环境影响评价文件；组织开展强制性清洁生产初审工作；拟订并组织实施生态环境准入清单。
（十一）负责生态环境监测工作。拟订并监督实施地方性生态环境监测制度、规范和标准；会同有关部门统一规划生态环境质量监测站点设置，组织实施生态环境质量监测、污染源监督性监测、温室气体减排监测、应急监测。组织对生态环境质量状况进行调查评价、预测预警；组织建设和管理生态环境监测网和生态环境信息网，建立和实行生态环境质量公告制度，发布生态环境信息和生态环境状况公报。
（十二）负责应对气候变化工作。协调实施应对气候变化及温室气体减排的规划和政策措施；负责全市应对气候变化及碳减排的日常工作。
（十三）开展生态环境保护督察。配合中央、省生态环境保护督察工作，协调本市生态环境保护督察相关工作。
（十四）组织、指导和协调生态环境宣传教育工作，组织实施生态环境保护宣传教育纲要，推动社会组织和公众参与生态环境保护，指导生态环境科技工作。
（十五）参与生态环境国际合作和交流，参与处理涉外有关生态环境事务。
（十六）完成市委、市政府和上级部门交办的其他任务。
（十七）职能转变：市生态环境局要统一行使生态和城乡各类污染排放监管与行政执法职责，切实履行监管责任，全面落实大气、水、土壤污染防治行动计划。构建政府为主导、企业为主体、社会组织和公众共同参与的生态环境治理体系，实行最严格的生态环境保护制度，严守生态保护红线和环境质量底线，坚决打好污染防治攻坚战，保障全市生态安全。
（十八）有关职责分工
与市农业农村局有关职责分工：
（1）市生态环境局对农业农村污染治理实施统一监督指导，会同市农业农村局等有关部门加强污染治理信息共享、定期会商、督导评估，形成“一岗双责”、齐抓共管的工作格局。
（2）市农业农村局牵头负责农村生活垃圾污水治理、农业污染源头减量和废弃物资源化利用。
